日本本土に分布する種では、ヤマトシロアリと、イエシロアリが代表的で、この2種はいずれもミゾガシラシロアリ科に分類されます。

建物や土中に塊状の大きな巣をつくり、普通数十万匹、大きいものでは100万匹にも達します。加害速度も速く、被害は激烈です。建物の乾燥した木材でも水を運んできて湿しながら加害しますので、被害は建物全体に及びます。

ヤマトシロアリは土や木の中に巣穴を作って生活しています。特別に加工した塊状の巣はつくらず、加害箇所が巣をかねており、適当な生活場所と餌を求めて集団で移動する習性があります。巣穴は網目状になった孔の連続からなり、シロアリはその周辺を食べながら巣を広げます。場合によっては表面に木くずを積み重ねたトンネルを造ってその中を移動します。とくに湿潤なところを好むので、湿った木材や土中で生活していることが多く、主に建物下部を加害します。被害は腐朽と同時に起こることが多く、食痕は多湿で汚ないですが、建物上層部に及ぶことは、あまりありません。